Наука не может дать окончательного объяснения этому феномену. Физик Андрей Волков из Курчатовского института, изучая явление с помощью специальных приборов, зафиксировал странный импульс — резкое повышение электромагнитного излучения перед появлением огня. Научные исследования лишь подтверждают необычность явления, не отвергая его чудесную природу. Известно три случая, когда Благодатный огонь не сошел в назначенное время. Первый был в 1101 году, когда в храм допустили только латинян; второй — в 1579 году, когда не пустили православного патриарха; третий — в 1923 году, когда не впустили арабскую молодежь. Во всех случаях чудо произошло только после того, как в храме оказались все верующие. Эти события трактуются как знамения — напоминание о том, что Божий храм должен быть открыт для всех. Три таких прецедента считаются предупреждениями. В христианской традиции число три носит сакральный смысл, и это заставляет задуматься, будут ли новые предостережения или следующий случай несхождения Благодатного огня может стать началом апокалиптических событий.